El máximo órgano de gobierno de MetaRed es el Comité de Presidentes/as Rectores/as Internacional encargado de marcar las líneas estratégicas de MetaRed.
El Comité está formado por los Presidentes/as Rectores/as de cada una de las redes pertenecientes a MetaRed:
- Argentina: Dr. Daniel Vega, Presidente de MetaRed TIC Argentina y Rector de la Universidad Nacional del Sur.
- Brasil: Dª Lúcia Teixeira, Presidenta de MetaRed TIC Brasil, Presidenta de Semesp y Rectora de UNISANTA. Universidade Santa Cecilia.
- Centroamérica y Caribe: Dr. Carlos Araya Leandro, Presidente de MetaRed TIC Centroamérica y Caribe.
- Chile: Dr. Carlos Torres, Presidente de MetaRed TIC Chile y Rector de la Universidad de Talca.
- Colombia: Padre Luis Fernando Múnera Congote, S.J. Presidente de MetaRed TIC Colombia y Rector de la Pontificia Universidad Javeriana
- Ecuador: Dra. Cecilia Paredes Verduga, Presidenta de MetaRed TIC Ecuador, Presidenta de CEDIA y Rectora de la Escuela Superior Técnica del Litoral, ESPOL.
- España: Daniel Crespo Artiaga, Presidente de Crue-TIC y Rector de Universitat Politécnica de Catalunya.
- México: Luis Armando González Placencia, Presidente de MetaRed TIC México y Secretario General Ejecutivo de la ANUIES.
- Perú: Dr. Edward Roekaert Embrechts , Presidente de MetaRed TIC Perú y Rector de la Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas.
- Portugal: Dra. Herminia Vasconcelos Vilar, Presidenta de MetaRed TIC Portugal y Rectora de la Universidad de Évora.
Cada una de las redes cuenta con una Coordinación Global, desde la cual se planifican las acciones que se realizan en cada una de las redes, teniendo como guía las líneas estratégicas propuestas por los Presidentes/as Rectores/as. Todas ellas forman parte del Comité de Coordinación internacional de MetaRed:
- Argentina: Dña Elsa Estévez. Coordinadora Global de MetaRed TIC Argentina y Cátedra UNESCO de Sociedades del Conocimiento y Gobernanza Digital de la Universidad Nacional del Sur.
- Brasil: D. Fábio Garcia Reis. Coordinador Global de MetaRed TIC Brasil y Director de Innovación y Redes de SEMESP.
- Centroamérica y Caribe: D. Alonso Castro Mattei. Coordinador Global de MetaRed TIC Centroamérica y Caribe y Director TI de la Universidad de Costa Rica.
- Chile: Dña. Ariela Vergara Jaque. Secretaria Ejecutiva de MetaRed TIC Chile y Vicerrectora de Innovación de la Universidad de Talca.
- Colombia: D. Luis Francisco Martínez. Coordinador Global de MetaRed TIC Colombia y CIO Pontificia Universidad Javeriana.
- Ecuador: D. Luis Vargas Tola, Coordinador Global de MetaRed TIC Ecuador y Jefe de Planificación y Gestión Estratégica de CEDIA.
- España: D. Pedro Miguel Ruíz Martínez. Coordinador Global de Crue-TIC y Vicerrector de Estrategia y Universidad Digital de la Universidad de Murcia.
- México: D. José Luis Ponce López. Coordinador Global de MetaRed TIC México y Director de Tecnología de la Información de la ANUIES.
- Perú: D. Jorge Bossio. Coordinador Global de MetaRed TIC Perú y Director de aprendizaje y Online de la Universidad Peruana de Ciencias Aplicadas.
- Portugal: D. Joaquim José Santos Lopes Godinho. Coordinador Global de MetaRed TIC Portugal y Director del Servicio de Informática de la Universidade de Evora.
En cada red existe un Comité al que pertenecen además del Presidente/a Rector/a y del Coordinador/a Global las personas que coordinan los diferentes grupos de trabajo de dicha red, se pueden consultar todas las personas en las páginas webs de cada una de las redes.